Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms