Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms