Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPHKAPQ2M3C7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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