Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SKIDA1Q1XH10 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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