Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms