Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SNAPC1Q16533 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SNAPC1Q16533 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SNAPC1Q16533 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SNAPC1Q16533 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SNAPC1Q16533 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SNAPC1Q16533 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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SNAPC1Q16533 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SNAPC1Q16533 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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