Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18Q15532 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18Q15532 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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