Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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