Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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