Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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