Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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