Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ASAH1-222ENST00000636160 2328 ntTSL 517.08■□□□□ 0.324e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-245ENST00000637244 3151 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.134e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.084e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-269ENST00000638069 3068 ntTSL 512.93□□□□□ -0.344e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ARHGDIB-204ENST00000539131 590 ntTSL 29.56□□□□□ -0.884e-15■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.964e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-220ENST00000636050 2546 ntTSL 58.53□□□□□ -1.044e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-253ENST00000637609 4981 ntTSL 57.99□□□□□ -1.134e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.154e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-218ENST00000636009 2148 ntTSL 56.97□□□□□ -1.294e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.344e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-262ENST00000637857 2585 ntTSL 55.88□□□□□ -1.474e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.674e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.23e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.072e-25■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-25■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SSBP1-210ENST00000481508 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-25■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SSBP1-208ENST00000469123 662 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-25■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-25■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.522e-25■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.678e-10■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.458e-10■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.058e-10■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 224.13■■□□□ 1.451e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.461e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.351e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.341e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.171e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.151e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.091e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 01e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.857e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-203ENST00000585722 1147 ntTSL 220.33■□□□□ 0.857e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.857e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.857e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.797e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.777e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-209ENST00000588321 1310 ntTSL 519.07■□□□□ 0.647e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-206ENST00000586701 563 ntTSL 518.96■□□□□ 0.637e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.637e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.637e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.357e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.37e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 DHX37-204ENST00000542400 3065 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 DHX37-203ENST00000539298 4550 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.012e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-204ENST00000586218 593 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.147e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-215ENST00000592952 428 ntTSL 513.94□□□□□ -0.187e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMEM205-212ENST00000590482 619 ntTSL 512.34□□□□□ -0.437e-9■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 ERGIC3-216ENST00000488384 766 ntTSL 219.03■□□□□ 0.643e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 BAX-210ENST00000513217 869 ntTSL 217.22■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.596e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.846e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.586e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.56e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 NUDT1-209ENST00000487426 872 ntTSL 217.85■□□□□ 0.456e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.376e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.376e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.346e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.346e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 IRF3-211ENST00000596644 550 ntTSL 217.83■□□□□ 0.442e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 317.31■□□□□ 0.362e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TRMT2A-205ENST00000444256 426 ntTSL 519.08■□□□□ 0.642e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TRMT2A-215ENST00000487378 654 ntTSL 218.1■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.711e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.242e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.361e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 SUPT4H1-205ENST00000581166 1401 ntTSL 216.92■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 SUPT4H1-206ENST00000581204 539 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RPL13-215ENST00000570149 435 ntTSL 215.36■□□□□ 0.051e-41■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 AL590867.2-201ENST00000492974 447 ntBASIC10.67□□□□□ -0.74e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-216ENST00000636660 1126 ntTSL 516.28■□□□□ 0.24e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.016e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RNASEH2A-204ENST00000593017 1487 ntTSL 219.72■□□□□ 0.756e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.773e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-8■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 DNAJC4-204ENST00000535246 502 ntTSL 316.72■□□□□ 0.275e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.61■■□□□ 1.211e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-37■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-37■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 SRA1-202ENST00000520427 978 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 514.67□□□□□ -0.062e-37■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.63e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.575e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.545e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.375e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-206ENST00000587326 1839 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.155e-10■■■□□ 17.9
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 140.8 ms