Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms