Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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NR1H3Q13133 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NR1H3Q13133 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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