Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms