Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms