Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms