Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA3Q08378 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms