Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms