Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms