Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms