Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms