Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID5AQ03989 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms