Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms