Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms