Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO4P61968 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO4P61968 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMO4P61968 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms