Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms