Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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