Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms