Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms