Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.739e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PHACTR4-205ENST00000632202 918 ntTSL 524.26■■□□□ 1.472e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PHACTR4-209ENST00000633371 597 ntTSL 321.6■■□□□ 1.052e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PHACTR4-203ENST00000463428 1421 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.992e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PHACTR4-206ENST00000632421 3375 ntTSL 217.24■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PHACTR4-204ENST00000493669 3078 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.052e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 SPOPL-203ENST00000430968 558 ntTSL 538.52■■■■□ 3.762e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.12e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.092e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.82e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)31.57■■■□□ 2.642e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.642e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 531.39■■■□□ 2.622e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP33-212ENST00000524778 389 ntTSL 530.27■■■□□ 2.443e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.412e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.32e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.282e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.142e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP33-213ENST00000525113 497 ntTSL 327.9■■■□□ 2.063e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.052e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.92e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.762e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP33-215ENST00000528150 500 ntTSL 325.85■■□□□ 1.733e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 SND1-203ENST00000463020 793 ntTSL 225.74■■□□□ 1.712e-15■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.62e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TMEM243-206ENST00000474074 1031 ntTSL 224.58■■□□□ 1.532e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NUTM2A-AS1-211ENST00000456104 486 ntTSL 323.94■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPARA-205ENST00000420804 572 ntTSL 223.24■■□□□ 1.312e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.212e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 DTD1-203ENST00000618693 695 ntTSL 522.26■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NUTM2A-AS1-207ENST00000433920 876 ntTSL 321.13■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP33-211ENST00000524536 949 ntTSL 320.93■□□□□ 0.943e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP32-207ENST00000588898 578 ntTSL 519.6■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 WDR27-209ENST00000486490 492 ntTSL 519.27■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP32-202ENST00000393003 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP32-210ENST00000589761 430 ntTSL 216.37■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 215.71■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 WDR27-205ENST00000467418 947 ntTSL 515.68■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPARA-210ENST00000493286 1564 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 LARGE1-206ENST00000421768 658 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 AKAP13-218ENST00000560340 553 ntTSL 412.73□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ADD1-224ENST00000539108 244 ntTSL 312.72□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 CAB39-207ENST00000614925 1619 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NFKBIZ-206ENST00000477601 548 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 AKAP13-222ENST00000560676 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.29□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-208ENST00000581273 488 ntTSL 310.63□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPP2R5A-202ENST00000479259 740 ntTSL 510.06□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NFKBIZ-210ENST00000495089 877 ntTSL 29.85□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-206ENST00000521179 591 ntTSL 59.46□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-202ENST00000419890 537 ntTSL 59.46□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ADD1-226ENST00000540541 546 ntTSL 28.59□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 CAB39-205ENST00000484398 552 ntTSL 47.94□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPP2R5A-203ENST00000498123 399 ntTSL 25.67□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NUTM2A-AS1-206ENST00000433530 401 ntTSL 35.6□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPP2R5A-204ENST00000498129 745 ntTSL 55.4□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TVP23C-207ENST00000523573 764 ntTSL 55.37□□□□□ -1.552e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PDE3B-204ENST00000532740 788 ntTSL 25.28□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TMEM243-207ENST00000481425 497 ntTSL 34.9□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.72e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NFKBIZ-211ENST00000495719 482 ntTSL 24.33□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 TMEM243-205ENST00000465976 459 ntTSL 33.55□□□□□ -1.842e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.022e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.275e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ACSF3-211ENST00000540697 829 ntTSL 228.97■■■□□ 2.235e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.395e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 ATXN10-206ENST00000464482 439 ntTSL 311.74□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.475e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.425e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.45e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 232.69■■■□□ 2.827e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 529.45■■■□□ 2.317e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 FAM60A-208ENST00000543615 669 ntTSL 528.66■■■□□ 2.183e-8■■■■□ 22
HNRNPMP52272 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 320.57■□□□□ 0.887e-7■■■■□ 22
HNRNPMP52272 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.512e-6■■■■□ 22
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 644 ms