Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CX3CR1P49238 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms