Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms