Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ME1P48163 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME1P48163 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME1P48163 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME1P48163 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms