Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms