Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms