Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms