Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO1P25800 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO1P25800 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms