Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRB1P17538 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRB1P17538 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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