Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMBP08118 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMBP08118 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms