Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P02748 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P02748 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P02748 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P02748 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P02748 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P02748 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P02748 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P02748 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P02748 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P02748 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P02748 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P02748 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P02748 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P02748 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P02748 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P02748 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms