Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGAP02671 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGAP02671 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGAP02671 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms