Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC1P02654 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms