Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF253O75346 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF253O75346 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF253O75346 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF253O75346 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF253O75346 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF253O75346 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF253O75346 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF253O75346 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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