Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG13O75143 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG13O75143 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms