Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms