Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms