Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms