Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms