Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VWA8A3KMH1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VWA8A3KMH1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VWA8A3KMH1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VWA8A3KMH1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms